องค์การบริหารส่วนตำบลทองเอน อำเภออินทร์บุรี จังหวัดสิงห์บุรี ได้รับการยกฐานะจากสภาตำบลเป็นที่ทำการองค์การบริหารส่วนตำบลทองเอน เมื่อวันที่ 23 มีนาคม 2539 และต่อมาได้มีการสร้างที่ทำการใหม่ เมื่อวันที่ 7 มกราคม 2548 ตั้งอยู่ที่เลขที่ 3 หมู่ 13 ตำบลทองเอน อำเภออินทร์บุรี จังหวัดสิงห์บุรี ตั้งอยู่ทางทิศฝั่งตะวันออกของแม่น้ำเจ้าพระยา ห่างจากที่ว่าการอำเภออินทร์บุรี ไปทางทิศตะวันออกระยะทางประมาณ 5 กิโลเมตร
มีพื้นที่อยู่ในความรับผิดชอบทั้งหมด 38,001 ไร่ แบ่งเขตการปกครองออกเป็น 15 หมู่บ้าน โดยมีประชากรชาย จำนวน 3,709 คน ประชากรหญิง จำนวน 3,969 คน รวมจำนวนประชากรทั้งสิ้น 7,678 คน มีจำนวนครัวเรือนทั้งหมด 2,577 ครัวเรือน
